Matrix serisi, temel olarak insanlığın yapay zeka tarafından kontrol edildiği bir dünyada geçen olayları anlatır. Hikaye yedi ana bölümden oluşur: 1. İkinci Rönesans: İnsanoğlu yapay zekaya can vermiş ve makineleri tüm yükümlülüklerini devretmiştir. 2. Savaş: Makineler, insanların saldırısına karşı hazırlıklı olup, onları yeryüzünden siler. 3. Yeni Dünya Düzeni: Makineler, insan bedenindeki ısıyı elektrik enerjisine dönüştürerek yeni bir enerji kaynağı bulur. 4. Matrix: Matrix programının tasarımcısı, insan için kusursuz bir dünya kurar. 5. Seçilmiş Kişi (The One): Yüzyıllar süren döngüde kurtarılan insanlar, Zion adını verdikleri yeraltı şehrini kurar. 6. Döngünün Sonu: Virüs gibi kendini kopyalayan Smith, tüm Matrix'i ele geçirir ve Neo, onu ve kendini yok etmek zorunda kalır. 7. Barış: Neo, makine şehriyle anlaşma yaparak savaşı sona erdirir.