Evet, Kaptan Pengu 1 ve 2 bağlantılıdır. Kaptan Pengu ve Arkadaşları 2, Kaptan Pengu önderliğindeki grubun iklim değişikliği, doğal afetlerin artışı, kuraklık gibi sorunlara değinmesini odağına alır. Dolayısıyla, ikinci filmdeki olaylar ve karakterler, ilk filmin devamı niteliğindedir.