Jaan Nisar dizisinin konusu, bir derebeyinin oğlu olan Nosherwan Ghaznavi'nin, abisinin ölümünün ardından üstlendiği sorumluluklarla yüzleşmesini ve Dua ile tanıştıktan sonra hayatının değişmesini anlatır. Dua, yoksul bir ailenin kızıdır ve yaşadığı koşullardan memnun değildir. Dizide, Nosherwan Ghaznavi'nin aşkı bulup bulamayacağı ve görevleri ile Dua'ya olan sevgisi arasında nasıl bir denge kuracağı işlenir.