"Hotaru no Haka" (Ateş Böceklerinin Mezarı), II. Dünya Savaşı sırasında hayatta kalmaya çalışan iki kardeşin hikayesini anlatır .
Filmde, bombalanan Kobe şehrinde yaşayan 14 yaşındaki Seita ve dört yaşındaki kız kardeşi Setsuko'nun yaşam mücadelesi konu edilir . Anneleri Amerikan bombardımında öldüğünde, babaları da donanmada denizci olduğu için teyzelerinin yanına gönderilirler .
Teyzelerinin evinde gördükleri muameleden rahatsız olan kardeşler, kendi başlarına yaşam savaşı vermeye başlarlar . Açlık, önyargı ve kendi gururlarıyla mücadele eden Seita ve Setsuko, bu süreçte birçok zorluğa göğüs germek zorunda kalırlar .