Godzilla vs. Biollante, genetik mühendislik ve insan hırsının yol açtığı tehlikeleri konu alır. Olayların özeti: Godzilla'nın Tokyo'ya saldırmasının ardından, hücreleri Saradia Enstitüsü'ne götürülür. Bir yanardağ patlaması, hücrelerin yayılmasına neden olur ve Biollante adlı bir canavar doğar. Biollante, Godzilla ile savaşır ve Godzilla, Biollante'yi yener gibi görünür. Ancak Biollante, sporlara dönüşerek kaçar. Dr. Shiragami, kızının sporlar arasında olduğunu görür ve dışarı çıkarken öldürülür. Film, sosyal yorum unsuru olarak nükleer silahlara da değinir. Yönetmen Kazuki Omori, bu filmi 80'lerin vücut korku filmlerindeki dönüşüm efektlerinden esinlenerek yaratmıştır.