Gizemli Benedict Derneği'nin 2. sezonunda ekip, çeşitli gizemli görevler ve maceralarla dolu bir yolculuğa çıkar. Bazı olaylar: - 1. Bölüm: Benedict Derneği üyeleri, gizemli bir anahtar arayışına girer ve tehlikeli bir göreve atılırlar. - 2. Bölüm: Milligan'ın geçmişi ve karanlık sırları ortaya çıkar; ekip, gizli bir laboratuvarda tehlikeli bir deneyin peşine düşer. - 5. Bölüm: Ekip, gizemli bir uyuşturucu şebekesini çökertmek için harekete geçer ve Reynie, Milligan'ın geçmişiyle ilgili şüpheleri üzerine toplar. - 8. Bölüm: Benedict Gizemleri Derneği, ölümcül bir görev için tehlikeli bir oyunun içine girer ve bir kaçış planı yapar. Ayrıca, sezon boyunca Bay Benedict ve Number Two'nun kaybolması ve Dr. Curtain'in operasyonuyla ilgili olaylar da işlenir.