Game of Thrones'un 3. sezonu, George R. R. Martin'in "A Song of Ice and Fire" adlı kitap serisinin üçüncü romanı "A Storm of Swords"tan uyarlanmıştır. Sezon, Westeros'ta süren iç savaşı ve çeşitli karakterlerin bu savaş içindeki mücadelelerini anlatır. Öne çıkan olaylar ve temalar şunlardır: Tyrion Lannister: Kral Joffrey ile olan ilişkisinde zorluklarla baş ederken, siyasi hamlelerde bulunur. Daenerys Targaryen: Ejderhalarının varlığı ile güç kazanır ve Yedi Krallık'a giden yolda destekçiler arar. Jon Snow: Mance Rayder'ın topladığı orduya sızarak yabanılların planlarını öğrenmeye çalışır. Robb Stark: Krallığını kazanmak için kararlar alırken, aynı zamanda Frey hanesi ile olan anlaşmazlığı çözmeye çalışır. Theon Greyjoy: Kışyarı'ndaki eylemlerinin sonuçlarını yaşar ve işkencelere maruz kalır. Sezon, ayrıca ahlaki ikilemler, ittifaklar ve ihanetler gibi temaları da işler.