Élite dizisinin 2. sezonu, sınıf arkadaşlarından birinin ölümünün ardından bir öğrencinin kaybolmasıyla gelişen olayları konu alır. Bazı olaylar: İttifaklar değişir ve ortama yeni arkadaşlar katılır. Karanlık sırların saklanması zorlaşır. Samuel, Marina'nın Nano tarafından öldürüldüğüne inanmaz ve Carla ile Polo'dan şüphelenmeye başlar. Polo, Ander'e olan duygularını itiraf eder, bu da Ander'in dengesini bozar ve Omar ile olan ilişkisine zarar verir. Sezonda, Samuel'in kaybolması merkezde yer alır ve bu durum, cinayetin çözülmesi için kritik bir öneme sahiptir.