Baba Ocağı filminin konusu, iki kardeş arasındaki çatışmayı ve bir cinayetle başlayan olayları anlatır. Başlıca olaylar: Güneylioğlu ailesinin iki çocuğu, Halil ve Kemal, babalarını bir cinayet sonucu kaybeder. Halil, teşkilat olarak adlandırılan bir yapılanmaya karşıdır ve kardeşinin bu yapıya katılmasına karşı çıkar. Kemal, teşkilata katılır ve Halil, babasının ölümüne sebep olan muhbir Nuri'yi öldürür. Bunun üzerine teşkilat, Halil için ölüm kararı çıkarır. Halil, eşi Selma ile doğup büyüdüğü köye, "baba ocağı"na döner. Teşkilat, Halil'i öldürmesi için kardeşi Kemal'i gönderir. Film, aynı zamanda 2008-2009 yılları arasında yayınlanmış bir Türk televizyon dizisinin de adıdır.