Çağla ile Yeni Bir Gün programında Prof. Dr. Yusuf Kalko'nun neden yer almadığı sorusuna dair doğrudan bir bilgi bulunmamaktadır. Ancak, programın sunucusu Çağla Şıkel, birkaç gün programa çıkamama nedenini gıda zehirlenmesi ve ardından gelen tedavi süreci olarak açıklamıştır.