Behzat Ç. dizisinin 2. sezonunda yaşanan bazı olaylar şunlardır: Kesik Parmak Cinayetleri: Suna'nın katil olduğu ortaya çıkar ve intihar eder. Savcı Esra'nın Evliliği: Behzat Ç., Savcı Esra ile evlenir ve Şule'yi kızı olarak kabul eder. Yeni Karakterler: Narkotik komiseri Suna (Mine Tugay), psikolog Funda (Yasemin Öztürk) ve cinayet eski başkomiseri Aziz (Ahmet Uğurlu) diziye dahil olur. Cinayetler: Ekip, bir yandan kendi yokluklarında faili meçhule bırakılan cinayetleri çözer, bir yandan da işlenen yeni cinayetleri aydınlatmaya çalışır. Kişisel İlişkiler: Harun ve Eda çıkmaya başlar, Akbaba babasıyla hesaplaşır. Savaş'ın Dönüşü: Savcı Esra'nın eskiden görüşmediği kardeşi Savaş, diziye dahil olur. 2. sezon, 13 Kasım 2011'de yayınlanan 39. bölümle başlamış ve 17 Haziran 2012'de yayınlanan "Akıntıya Karşı..." isimli 69. bölümle tamamlanmıştır.