Barbie: Peri Gizemi (Barbie: A Fairy Secret) filmi, çevremizde yaşayan gizemli perileri keşfeden Barbie'nin Ken'i kurtarmak için yaşadığı macerayı anlatıyor. Hikayeye göre, Ken bir grup peri tarafından kaçırılınca Barbie büyük bir sırrı öğrenir: Barbie'nin tasarımcı arkadaşları aslında kanatları olan perilerdir ve Ken, sihirle kaplı gizli bir dünyaya götürülmüştür. Barbie, Ken'i geri getirmek için rakibi Raquelle ile birlikte peri arkadaşlarıyla birlikte bir yolculuğa çıkar.