Adem'in Trenleri, Anadolu'nun küçük kasabalarında geleneklerin baskısıyla hayatları şekillenen üç insanın öyküsünü anlatıyor. Filmin konusu kısaca şu şekilde özetlenebilir: Birbirlerine aşık olan Hacer ve Bekir evlenmeden birlikte olurlar ve Bekir kısa zaman sonra Hacer'i terk eder. Film, sevgi, tutku, iyilik, kötülük, günah, sevap gibi insani kavramları sorguluyor ve iç hesaplaşmaların bu kavramların ayrılmaz bir parçası olduğunu vurguluyor.