Gestaş Deniz Ulaşım, %99,87 hissesine sahip olan Çanakkale İl Özel İdaresi'ne aittir .
Şirket, 2006 yılı Ağustos ayında Çanakkale bölgesindeki iskeleler ve deniz ulaşımının özelleştirme kararıyla Türkiye Denizcilik İşletmeleri'nden (TDİ) Çanakkale İl Özel İdaresi'ne devriyle faaliyetlerine başlamıştır .