Emlak Katılım Bankası ve Vakıf Katılım'ın logoları farklıdır. Emlak Katılım Bankası'nın logosu, "Yerel üretimi ve sosyal projeleri destekleyen, finansal sistem ile reel sektör arasında güçlü ve sürdürülebilir bir ilişki kuran katılım bankası" temasını yansıtmaktadır. Vakıf Katılım'ın logosu ise, çeşitli formatlarda (PNG, PDF, EPS vb.) indirilebilen ve bankanın resmi web sitesinde yer alan logolar arasında bulunmaktadır.