Anadolu Üniversitesi'nde 12 fakülte bulunmaktadır. Bu fakülteler şunlardır: Eczacılık Fakültesi; Edebiyat Fakültesi; Eğitim Fakültesi; Güzel Sanatlar Fakültesi; Hukuk Fakültesi; İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi; İletişim Bilimleri Fakültesi; Sağlık Bilimleri Fakültesi; Turizm Fakültesi; Bilgisayar ve Bilişim Bilimleri Fakültesi; Açıköğretim Fakültesi; İktisat Fakültesi. Ayrıca, Anadolu Üniversitesi'nde 2 enstitü, 2 yüksekokul, 3 meslek yüksekokulu ve 1 devlet konservatuvarı da bulunmaktadır.