Setup.exe ve setup.msi dosyaları, farklı amaçlar için geliştirilmiş olup, her birinin kendine özgü avantajları ve dezavantajları bulunmaktadır. - Setup.exe: Bu dosyalar, yürütülebilir dosyalar olup, programları veya kurulum dosyalarını çalıştırmak için kullanılır. - Setup.msi: Bu dosyalar, Microsoft Installer (MSI) dosyalarıdır ve Windows Installer kullanarak yazılımların kurulumunu, bakımını ve kaldırılmasını sağlarlar. Sonuç olarak, hangi dosyanın daha iyi olduğu, kurulum sürecinin karmaşıklığına, güvenlik gereksinimlerine ve yazılımın dağıtım şekline bağlı olarak değişir.