"Tanrım Orada Mısın? Benim, Margaret" filmi, 11 yaşındaki Margaret'in ailesiyle birlikte New York City'den New Jersey'e taşınmasını ve bu süreçte yaşadığı zorlukları anlatıyor. Margaret, yeni mahallesinde kendi gibi sorularla dolu çocuklarla tanışır ve yeni arkadaşlar edinir. Margaret'in ailesi farklı dinlere mensup olduğu için, o da din konusunda kafa karışıklığı yaşar.