Merzifon'da havanın soğuk olmasının nedeni, soğuk mevsimin yaşanması ve bölgenin karasal iklim özellikleridir. Şehir, kış aylarında ortalama sıcaklığın 9°C'nin altına düştüğü soğuk bir döneme girmektedir. Ayrıca, rakımın yüksek olması ve deniz etkisinden uzak olması da hava sıcaklığının düşmesine katkıda bulunmaktadır.