Kalem kutusu çeşitleri oldukça çeşitlidir ve bazı türleri şunlardır: Bölmeli kalem kutuları: Çoklu bölmelere sahip kalem kutuları, özellikle öğrenciler için yazı kalemlerini boya kalemlerinden ayırmak gibi farklı kalem türlerini ayırmak için kullanılır. Rulo kalem kutuları: Özellikle çizim işleriyle ilgilenenler tarafından tercih edilir. Şeffaf kalem kutuları: Hem minimalist bir görünüm sunar hem de içeriğin kolayca görünmesini sağlar. Otomatik mekanizmalı kalem kutuları: Düzenli çalışmayı kolaylaştıran işlevsel tasarımlardır. Lastikli kalem kutuları: Basit ve hızlı bir şekilde çanta, defter veya kitap gibi nesnelere bağlanarak kaybolmasını önler. Makyaj çantası veya seyahat çantası şeklinde kalem kutuları: Kadınlar tarafından makyaj malzemelerini veya kişisel eşyalarını düzenlemek için kullanılır. Çizgi film karakterli kalem kutuları: Özellikle çocuklar tarafından tercih edilir, ancak yetişkinler tarafından da kullanılabilir. Bu türler dışında, farklı malzemelerden (deri, plastik, silikon vb.) ve tasarımlardan (minimalist, füme, siyah vb.) yapılan kalem kutuları da bulunmaktadır.