İmam Seyfi Çalışkan, ateist olduğunu açıklamasıyla birlikte Diyanet İşleri Başkanlığı tarafından istifaya davet edildiği için görevinden ayrılmadı .
Çalışkan, işine profesyonel olarak yaklaştığını ve dinin işlerini kişisel inançlarından ayrı tuttuğunu belirterek istifa etmesini gerektiren bir durum olmadığını ifade etti .