Harpy kartalı, birkaç nedenden dolayı tehlikeli olarak kabul edilir: 1. Yaşam Alanlarının Kaybı: Güney Amerika'nın yağmur ormanlarında devam eden ormansızlaşma, harpy kartalının yuvalama ve avlanma alanlarını daraltıyor. 2. Kaçak Avlanma: Çeşitli ülkelerde koruma altına alınmış olmasına rağmen, kaçak avlanma önemli bir tehdit olmaya devam ediyor. 3. Üreme Oranının Düşük Olması: Harpy kartalları, her iki ila üç yılda bir yalnızca bir yavru dünyaya getirdikleri için popülasyonun yeniden çoğalması zor.