Genelkurmay Başkanı'nın yetkileri şunlardır: 1. Savaşta başkomutanlık görevini Cumhurbaşkanlığı namına yerine getirmek. 2. Silahlı Kuvvetlerin savaşa hazırlanmasında personel, istihbarat, harekât, teşkilat ve eğitim hizmetlerine ait ilke ve öncelikler ile ana programları hazırlamak ve Millî Savunma Bakanının onayına sunmak. 3. Uluslararası anlaşma ve antlaşmaların askeri yönlerinin tayininde mütalaa vermek ve gerektiğinde bu toplantılara katılmak veya temsilci göndermek. 4. Şahsen veya yetkili kılacağı kişi ve kuruluşlarla, görev ve yetkilerine ait konularda ilgili bakanlıklar, daireler ve kurumlar ile doğrudan yazışma yapmak ve temaslarda bulunmak. 5. Genelkurmay karargâhında bulunan J başkanlıklarını yönetmek.