11. Bölge Müdürlüğü iki farklı kuruma bağlı olabilir: 1. Karayolları Genel Müdürlüğü: 11. Bölge Müdürlüğü, Karayolları Genel Müdürlüğü'ne bağlıdır ve çalışma alanı Van, Bitlis, Muş, Hakkari, Ağrı ve Siirt illerinin bir bölümünü kapsamaktadır. 2. Doğa Koruma ve Milli Parklar Genel Müdürlüğü: 11. Bölge Müdürlüğü, Doğa Koruma ve Milli Parklar Genel Müdürlüğü'nün Samsun'daki birimidir.