Tarım ve Orman Bakanlığı taşra teşkilatı, il ve ilçe müdürlüklerinden oluşur. Bakanlık il müdürlüğü, il müdürü yönetiminde aşağıdaki şube müdürlüklerinden meydana gelir: Gıda ve Yem Şube Müdürlüğü; Bitkisel Üretim ve Bitki Sağlığı Şube Müdürlüğü; Hayvan Sağlığı ve Yetiştiriciliği Şube Müdürlüğü; Balıkçılık ve Su Ürünleri Şube Müdürlüğü; Tarımsal Altyapı ve Arazi Değerlendirme Şube Müdürlüğü; Kırsal Kalkınma ve Örgütlenme Şube Müdürlüğü; Koordinasyon ve Tarımsal Veriler Şube Müdürlüğü; İdari ve Mali İşler Şube Müdürlüğü. Bakanlık ilçe müdürlüğü ise ilçe müdürü yönetiminde benzer şekilde yapılandırılmıştır. Ayrıca, ihtiyaç durumuna göre il veya şube müdürlüklerine bağlı hizmet birimleri oluşturulabilir.