Yugoslavya'nın dağılması, ekonomi üzerinde çeşitli olumsuz etkiler yarattı: Ekonomik kriz ve borç: 1980'lerin başında artan dış borç, hiper enflasyon ve üretim düşüşü gibi ekonomik sorunlar derinleşti. Bölgesel ekonomik eşitsizlik: 1974 Anayasası ile federe cumhuriyetlere tanınan haklar, ekonomik rekabetin artmasına ve bölgeler arası eşitsizliğin derinleşmesine yol açtı. Sosyal hizmetler ve yoksulluk: Yeni ekonomik politikalar, sosyal hizmetleri kâr odaklı hale getirdi ve dar gelirli gruplara yönelik federal devlet bütçesinden verilen refah fonlarının kesilmesine sebep oldu. Ayrıca, Yugoslavya'nın dağılması sürecinde Batı'nın, Uluslararası Para Fonu ve Dünya Bankası aracılığıyla yıkıcı şartlarla kredi vererek Yugoslavya ekonomisini zayıf düşürdüğü iddiaları da bulunmaktadır.