İstanbul Topkapı Üniversitesi'nde aşağıdaki fakülteler ve bölümler bulunmaktadır: 1. Güzel Sanatlar, Tasarım ve Mimarlık Fakültesi: Çizgi Film ve Animasyon, Dijital Oyun Tasarımı, Gastronomi ve Mutfak Sanatları, Görsel İletişim Tasarımı, Grafik Tasarım, İç Mimarlık ve Çevre Tasarımı, Mimarlık, Radyo, Televizyon ve Sinema, Resim, Tiyatro. 2. İktisadi, İdari ve Sosyal Bilimler Fakültesi: Ekonomi (Türkçe/İngilizce), Halkla İlişkiler ve Reklamcılık, Havacılık Yönetimi, İngiliz Dili ve Edebiyatı, İşletme (Türkçe/İngilizce), Psikoloji (Türkçe/İngilizce), Siyaset Bilimi ve Uluslararası İlişkiler (İngilizce), Tarih, Uluslararası Ticaret ve İşletmecilik (Türkçe/İngilizce), Yeni Medya ve İletişim, Yönetim Bilişim Sistemleri (Türkçe/İngilizce). 3. Mühendislik Fakültesi: Bilgisayar Mühendisliği, Bilgisayar Mühendisliği (İngilizce), Yazılım Mühendisliği, Elektrik - Elektronik Mühendisliği, Elektrik - Elektronik Mühendisliği (İngilizce). 4. Spor Bilimleri Fakültesi: Antrenörlük Eğitimi, Rekreasyon, Spor Yöneticiliği. 5. Sağlık Bilimleri Fakültesi. 6. Plato Meslek Yüksekokulu: Acil Durum ve Afet Yönetimi, Adalet, Ağız ve Diş Sağlığı, Ameliyathane Hizmetleri, Anestezi, Aşçılık, Bankacılık ve Sigortacılık, vb..