Anaerobikler, oksijen varlığında hayatta kalamadıkları veya üreyemedikleri için oksijensiz ortamda yaşarlar. Anaerobik bakteriler üç ana gruba ayrılır: Zorunlu anaeroblar. Fakültatif anaeroblar. Aerotolerant anaeroblar. Ayrıca, anaerobik mikroorganizmalar, enerji üretimi için oksijen yerine karbondioksit, hidrojen gazı, sülfat, nitrat veya kükürt gibi maddeleri kullanabilirler.