Celal Bayar Üniversitesi, 1992 yılında Manisa'da yükseköğretimin temelini oluşturan üç önemli okulu bir araya getirmek amacıyla kurulmuştur. Bu okullar: 1975 yılında Ege Üniversitesi İktisadi ve Ticari Bilimler Fakültesi'ne bağlı olarak kurulan Manisa Muhasebe Ön Lisans Yüksekokulu; 24 Kasım 1975'te kurulan Gençlik ve Spor Akademisi; 1964 yılında açılan ve 1974'te Öğretmen Lisesi'ne dönüştürülen Demirci Eğitim Enstitüsü'dür. Ayrıca, Dokuz Eylül Üniversitesi'ne bağlı olan bazı fakülteler ve yüksekokullar da Celal Bayar Üniversitesi'ne dahil edilmiştir.