Sakarya Üniversitesi'nin neden araştırma üniversitesi olamadığına dair kesin bir bilgi bulunmamaktadır. Ancak, üniversitenin araştırma üniversitesi olma sürecinde karşılaştığı bazı zorluklar şunlardır: Hastane nedeniyle bilimsel araştırmalara kaynak aktaramama. TÜBİTAK projelerinin geçmişte düşük olması. Sakarya Üniversitesi, 2023 yılının Aralık ayında Yükseköğretim Kurulu tarafından "Araştırma Üniversitesi Aday İzleme Programı"na dahil edilmiştir.