Sakarya Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü (FBE), fen, mühendislik ve teknik eğitim dallarında lisansüstü eğitim ve araştırma faaliyetleri yürütür. Başlıca görevleri: Akademik kadro yetiştirme: Bilimsel ve teknolojik yetkinliğe sahip akademisyenler ve profesyoneller yetiştirmek. Disiplinlerarası işbirlikleri: Üniversite, özel sektör ve kamu işbirliğini teşvik ederek yeni disiplinler arası işbirliklerinin geliştirilmesine katkı sağlamak. Eğitim ve öğretim: Yüksek lisans ve doktora programları ile toplum için nitelikli profesyoneller yetiştirmek. FBE, Sakarya Üniversitesi bünyesinde 13 fakülte, 6 enstitü, 2 yüksekokul ve 2 meslek yüksekokulu ile eğitim faaliyetlerini sürdürmektedir.