Rosatom'un mühendislik bölümü, nükleer enerji alanında çeşitli hizmetler sunan bir birimdir. Bu bölüm, aşağıdaki alt birimlerden oluşur: Atomenergoproekt AŞ: Tasarım enstitüleri, araştırma şubeleri ve inşaat iştirakleri ile Moskova, St. Petersburg ve Nizhny Novgorod'da faaliyet gösterir. Atomstroyexport: Rusya ve yurt dışında şubeleri bulunan bir anonim şirkettir. Faaliyet alanları: Nükleer santrallerin tasarımı ve inşası. Ekipman tedariki ve proje yönetimi. Yeni nesil reaktörlerin geliştirilmesi. Ayrıca, Rosatom'un mühendislik bölümü, Multi-D markalı yazılım ürünleri de geliştirmektedir.