Prof. Dr. Yusuf Şahin, farklı üniversitelerde ve kurumlarda çeşitli görevler üstlenmiştir: Ostim Teknik Üniversitesi: Makine Mühendisliği bölümünde profesör olarak görev yapmaktadır. Ankara Hacı Bayram Veli Üniversitesi: İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi, Siyaset Bilimi ve Kamu Yönetimi Bölümü, Kamu Yönetimi Anabilim Dalı'nda öğretim üyesi olarak çalışmaktadır. Aksaray Üniversitesi: 2015-2023 yılları arasında rektörlük yapmıştır. Ayrıca, AK Parti Çevre ve Şehircilik Başkan Yardımcısı olarak da görev almaktadır.