Pamukkale Üniversitesi'nde BAP projesi, Bilimsel Araştırma Projeleri (BAP) kapsamında desteklenen projelerdir. Bu projeler, yeni bilgiler üretmek veya teknolojik/sosyal problemleri çözmek amacıyla bilimsel esaslara uygun olarak yapılan çalışmalardır ve aşağıdaki türleri içerir: Başlangıç Seviyesi Araştırma Projeleri. Yüksek Lisans ve Doktora Tez Projeleri. Kurumsal Altyapı Projeleri. Hızlı Destek Projeleri. BAP projeleri, Pamukkale Üniversitesi BAP Koordinasyon Birimi tarafından desteklenir ve yönetilir.