ODTÜ Mezunları Ortaokulu'nun ders programı şu şekildedir: - 5, 6 ve 7. sınıflar için dersler 13:00'da başlayıp 17:30'da biter. - 8. sınıflar için dersler 08:00'da başlayıp 12:30'da biter. Ders programları, sınıf mevcutlarındaki dengesizlikler ve diğer zorunlu durumlar göz önünde bulundurularak okul idaresi tarafından değiştirilebilir.