Nautilus dizisinin konusu, 19. yüzyılda İngiliz Doğu Hindistan Ticaret Şirketi tarafından inşa edilen su altı gemisi Nautilus'u ele geçirme planları yapan Kaptan Nemo ve mürettebatlarının Hint Okyanusu'ndaki maceralarını takip eder. Hintli bir prens olan Kaptan Nemo, doğuştan gelen haklarını ve ailesini gasp eden Doğu Hindistan Şirketi'ne karşı mücadele etmektedir. Ayrıca, Jules Verne'in Denizler Altında Yirmi Bin Fersah adlı 1870 ve Esrarlı Ada adlı 1874 yılı romanlarında anlatılan Nautilus, hayal ürünü bir denizaltıdır.