MSÜ göz muayenesi, Türk Silahlı Kuvvetleri, Jandarma Genel Komutanlığı ve Sahil Güvenlik Komutanlığı sağlık kurulu raporu vermeye yetkili sağlık kuruluşlarında gerçekleştirilir. Muayene sırasında yapılan tetkikler şunlardır: 1. Akciğer ve direkt üriner sistem grafisi. 2. HBsAg, Anti-HCV, Anti-HIV testleri. 3. Tam kan sayımı ve sedimantasyon. 4. Tam idrar muayenesi. 5. Kanda üre, kreatinin, AST, ALT, ALP, LDH, GGT, bilirubinler, TSH, total kolesterol, trigliserit analizleri. 6. Açlık kan şekeri ölçümü. 7. Ultrasonografi (tüm batın). 8. EKG ve transtorasik ekokardiografi (gerekli durumlarda). Göz muayenesi kapsamında ise, her bir gözde görmenin tam olması ve göz derecelerinin 1.00 diyoptriyi aşmaması gerekmektedir.