Muğla Sıtkı Koçman Üniversitesi'nde (MSKÜ) aşağıdaki fakültelerde çeşitli bölümler bulunmaktadır: 1. Eğitim Fakültesi: Sınıf Öğretmenliği, Türkçe Öğretmenliği, Matematik Öğretmenliği, İngilizce Öğretmenliği. 2. İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi: İşletme, Ekonomi, Uluslararası İlişkiler, Çalışma Ekonomisi ve Endüstri İlişkileri. 3. Fen-Edebiyat Fakültesi: Matematik, Fizik, Kimya, Biyoloji, Türk Dili ve Edebiyatı, Tarih, Psikoloji. 4. Mühendislik Fakültesi: Bilgisayar Mühendisliği, Elektrik-Elektronik Mühendisliği, Endüstri Mühendisliği, İnşaat Mühendisliği, Makine Mühendisliği, Kimya Mühendisliği. 5. Sağlık Bilimleri Fakültesi: Hemşirelik, Fizyoterapi ve Rehabilitasyon, Beslenme ve Diyetetik. 6. Güzel Sanatlar ve Tasarım Fakültesi: Grafik Tasarımı, İç Mimarlık ve Çevre Tasarımı, Moda Tasarımı, Resim, Heykel. 7. İletişim Fakültesi: Gazetecilik, Radyo, Televizyon ve Sinema, Halkla İlişkiler ve Reklamcılık. Ayrıca, üniversitede 4 enstitü, 5 yüksekokul ve 12 meslek yüksekokulu da yer almaktadır.