Mersin Üniversitesi'nin beş ana kampüsü bulunmaktadır: 1. Çiftlikköy Kampüsü: Ana kampüs olup, yaklaşık 4 milyon metrekare alan üzerine kuruludur. 2. Yenişehir Kampüsü: Şehir merkezinde yer alır ve özellikle sağlık ve sanat alanlarında eğitim verir. 3. Tarsus Kampüsü: Tarsus ilçesinde bulunur ve uygulamalı teknoloji ile işletmecilik alanlarına odaklanır. 4. Erdemli Kampüsü: Mersin-Antalya yolu sahil bandında yer alır ve çevre bilimleri ile denizcilik alanlarında eğitim sunar. 5. Silifke Kampüsü: Silifke ilçesinde bulunur ve teknoloji ile işletmecilik odaklı eğitim verir.