Proje okulları, belirli kriterleri karşılayan okullar arasından seçilmektedir. Bu kriterler şunlardır: 1. Akademik Başarı: Okulun öğrencilerinin önceki başarı performansı, ulusal sınav sonuçları ve öğrenci başarı oranları dikkate alınır. 2. İnovatif Eğitim Uygulamaları: Okulun yenilikçi eğitim yöntemleri ve projeleri geliştirmesi önemlidir. 3. Öğretmen Kalitesi: Görev yapan öğretmenlerin yeterlilikleri, deneyimleri ve mesleki gelişimlerine katkıda bulunan eğitimler önemlidir. 4. Altyapı ve Kaynaklar: Okulun fiziki altyapısı, teknolojik donanımı ve eğitim kaynakları yeterli olmalıdır. 5. Toplumsal Katılım ve İşbirliği: Okulun, yerel topluluklar, aileler ve diğer eğitim kurumlarıyla işbirliği içinde çalışması önemlidir. 6. Sürdürülebilir Projeler: Gerçekleştirilen projelerin sürdürülebilirliği, uzun vadeli etkilerini değerlendirmek adına kritik bir kriterdir. Seçim süreci, Milli Eğitim Bakanlığı tarafından oluşturulan bir komisyon tarafından yürütülmektedir.