Marmara Üniversitesi'nin ambleminde yer alan "M" harfi, Marmara'yı temsil etmekte ve deniz dalgasını yansıtmaktadır. Amblemin tasarımında, üniversitenin baş harfinin stilize edilmesi ve bulunduğu şehri yansıtması amaçlanmıştır. Ancak, amblemle ilgili farklı görüşler de bulunmaktadır; bazı uzmanlar "M" harfindeki deniz dalgasının özgün bir buluş olmadığını düşünmektedir.