1883'teki Krakatoa patlamasının nedeni, birbirini iten tektonik levhalar olarak kabul edilir 1.

Hint-Avustralya levhası, yitim zonunda bulunan Asya levhası ile çarpışmış ve daha ağır olduğu için Sumatra kıta levhasının altına geçmiştir 1. Çarpışma noktasından girerek mantoya yaklaşan kayalar ısınmış, lav haline gelmiş ve basınçla yukarı fırlayarak yanardağı oluşturmuştur 1.

Krakatoa adasındaki üç koninin altında, sıcak mantoya açılan ve her an harekete geçebilecek kanallar bulunmaktaydı 1. 27 Ağustos 1883'teki büyük patlamadan 21 saat önceki Perboewatan patlamasının yarıda kesilmesinin sebebi, bu kanalın tıkanması olarak düşünülmektedir 1. Bu durum basıncı artırmış ve nihai patlamayı şiddetlendirmiştir 1.