Harp okullarında bulunan bölümler, okula göre değişiklik göstermektedir. Genel olarak Milli Savunma Üniversitesi'ne bağlı harp okullarında şu bölümler bulunmaktadır: Kara Harp Okulu: Elektronik ve Haberleşme Mühendisliği, Makine Mühendisliği, İnşaat Mühendisliği, Bilgisayar Mühendisliği, Savunma Yönetimi, Uluslararası İlişkiler, Tarih. Hava Harp Okulu: Elektronik Mühendisliği, Bilgisayar Mühendisliği, Endüstri Mühendisliği, Havacılık ve Uzay Mühendisliği. Deniz Harp Okulu: Endüstri Mühendisliği, Makine Mühendisliği, Gemi İnş. ve Gemi Makineleri Mühendisliği, Bilgisayar Mühendisliği, Elektrik - Elektronik Mühendisliği. Ayrıca, Astsubay Meslek Yüksekokulları bünyesinde de çeşitli bölümler mevcuttur.