Tokyo, Japonya'nın eski başkenti değildir. Tokyo, 1868'deki Meiji Restorasyonu'ndan sonra Japonya'nın başkenti olmuştur. Tokyo'nun Japonya'nın başkenti olmasının nedeni, İmparator Meiji'nin Kyoto'daki başkentten Edo olarak bilinen Tokyo'ya taşınmasıdır. Tokyo, 1603'te Tokugawa Şogunluğu'nun kurulmasından sonra önem kazanmış ve 18. yüzyılın ortalarında bir milyonun üzerinde nüfusa sahip bir şehir haline gelmiştir.