İÜ (İstanbul Üniversitesi) ve İÜC (İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa) arasındaki temel fark, bu kurumların farklı üniversiteler olmasıdır. 2018 yılında, 7141 sayılı kanunun yürürlüğe girmesiyle İstanbul Üniversitesi, İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa ve İstanbul Üniversitesi olarak ikiye ayrılmıştır. Günümüzde, Çapa Tıp Fakültesi (resmi adı: İstanbul Tıp Fakültesi) İstanbul Üniversitesi'ne bağlıyken, Cerrahpaşa Tıp Fakültesi İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa'ya bağlıdır.