İTÜ'de bilgisayar mühendisliği ve bilişim sistemleri mühendisliği aynı değildir. Bilgisayar Mühendisliği programı, İstanbul Teknik Üniversitesi'nde 1997 yılında kurulmuş bir bölümdür ve otomatik kontrol düzenleri, bilgisayar ağları ve iletişim sistemleri gibi konuları kapsar. Bilişim Sistemleri Mühendisliği ise, İstanbul Teknik Üniversitesi ile SUNY-Binghamton arasında yıl paylaşımı esasına dayalı bir uluslararası ortak lisans programıdır. Bu programda öğrenciler, öğrenimlerinin bir kısmını Türkiye'de, bir kısmını ise ABD'de tamamlarlar.