Fenerbahçe Üniversitesi, Fenerbahçe Eğitim, Kültür ve Sağlık Vakfı tarafından kurulmuştur. 2019 yılında, üniversitenin işletme hakları Medicana Sağlık Grubu'na devredilmiştir ve üniversite bundan sonra Medicana Fenerbahçe Üniversitesi olarak anılmaktadır.