Eczacılık fakültesi ders programı, genellikle temel bilimler, eczacılık meslek bilimleri ve eczacılık teknolojisi dersleri olmak üzere üç ana bölümde düzenlenir. İlk yıllarda kimya, analitik kimya, farmasötik botanik, biyoloji, biyokimya, fizyoloji gibi temel bilimler dersleri yer alır. İkinci yıldan itibaren farmakoloji, farmasötik kimya, farmakognozi gibi eczacılık meslek bilimleri dersleri eklenir. Son yılda ise serbest eczacılık, hastane eczacılığı ve endüstri eczacılığı gibi alanlarda seçmeli dersler ve mesleki yönlendirmeler yapılır. Ders programı, her üniversitenin fakültesine göre değişiklik gösterebilir.