Hint Okyanusu'nda bulunan bazı denizler şunlardır: Andaman Denizi; Arap Denizi; Bengal Körfezi; Kızıldeniz; Java Denizi; Basra Körfezi; Umman Denizi; Mozambik Kanalı. Ayrıca, Hint Okyanusu'nun güneyinde Sunda Adaları'nın bulunduğu bölgede en derin kısımlar yer alır (7.000 metreden fazla).