Bahçeşehir Okulları, eğitim sisteminde kişiye özgü öğretim modeli (KÖM) uygulamaktadır. KÖM'ün üç temel adımı: 1. Öğrenme stilinin belirlenmesi: Kişisel Öğrenme Stili Testi (KÖS) ile öğrencilerin öğrenme stilleri tespit edilir. 2. Öğrenmeyi değerlendirme: Akademik Gelişimi İzleme Sınavı (AGİS) ile öğrencilerin kazanımları değerlendirilir. 3. Öğrenmeyi pekiştirme: "Metodbox" ve "STOYS" sistemleri ile kazanımların takibi yapılır ve eksikler giderilir. Bahçeşehir Okulları, ayrıca 21. yüzyıl becerileri, mentor öğretmenlik sistemi, dijital eğitim ve sosyal takip programı gibi uygulamalar da sunmaktadır.